Was meinst du mit "Glossar für einen Kursbereich"? Verlinkst du die Glossareinträge?
Ansonsten kannst du in einem Kurs beliebig viele Glossare anlegen, es müssen dann einfach sekundäre Glossare sein.
Wenn du alle Wörter abrufbar haben möchtest, würde ich das Gesamtglossar in jeden Kurs hineinkopieren. Dazu kannst du ein Glossar exportieren und wieder importieren. Du müsstest dann halt allfällige Änderungen immer im gleichen Glossar durchführen und diese dann von Zeit zu Zeit wieder importieren.
Übringes: Wenn du ein Glossar hast, kannst du damit verschiedene Übungstypen wie Kreuzworträtsel, Lückentextaufgaben und auch MC-Fragen erzeugen, vorausgesetzt du hast die entsprechenden Plugins installiert.